In den kostenlosen Regeln gibt es tatsächlich keine Götter, denn diese sind auch immer mit einer Kampagnenwelt verbunden. Das Kampagnensetting für Pathfinder ist die Welt Golarion, die natürlich Götter hat. Die Welt ist nicht im PRD enthalten, irgendwie will der Verlag ja auch zu Geld kommen, man muss die entsprechenden Bücher eben kaufen.
Dein Link verweist tatsächlich auch nur auf das D'n'D Kampagnensetting Vergessene Reiche mit der Welt Faerun und deren Göttern. Es gibt noch Eberron, Dark Sun, Dragonlance und Greyhawk. (Das sind jedenfalls die, die mir einfallen) Diese Settings besitzen jeweils eigene Götter.